154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3570 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3570  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 451 aa  927    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 687 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  26.97 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.69 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  22.62 
 
 		 652 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.2 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.31 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 774 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  28.03 
 
 		 1454 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  24.31 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  21.96 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  24.88 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  25.23 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  24.43 
 
 		 901 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 963 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.24 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  21.78 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  21.78 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.13 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  19.94 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.41 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  21.76 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  20.78 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2046  hypothetical protein  24.74 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500116  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 		 643 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.46 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.15 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  20.82 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  22.22 
 
 		 616 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  22.53 
 
 		 1812 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  25.95 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.93 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.59 
 
 		 611 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.48 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  23.78 
 
 		 534 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.14 
 
 		 385 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.78 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.11 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  24.59 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.93 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  21.78 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  23.27 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  21.78 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.78 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.78 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.78 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  27.32 
 
 		 546 aa  53.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  24.24 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.67 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.67 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.32 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  23.41 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.36 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.17 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  21.38 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  22.56 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.08 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  22.84 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.24 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.3 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.09 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.78 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  21.33 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  20.86 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.59 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  22.04 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.59 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.59 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.59 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  25.44 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.72 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  25.33 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.58 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  21.01 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  22.3 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  20.94 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  23 
 
 		 611 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  24.57 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.29 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  21.2 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  23.28 
 
 		 1328 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.18 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.8 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  27.59 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  20.99 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  21.71 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  24.14 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>