14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00565 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00565  pectate lyase L  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  50 
 
 		 458 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  35.75 
 
 		 439 aa  98.2  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  37.43 
 
 		 437 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2204  pectate lyase  35.71 
 
 		 439 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  36.17 
 
 		 437 aa  91.7  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  38.96 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  36.25 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1528  Parallel beta-helix repeat protein  34.83 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  34.69 
 
 		 733 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1887  hypothetical protein  30.9 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  31.44 
 
 		 491 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  29.12 
 
 		 750 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 547 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>