29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03437 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  53.19 
 
 		 967 aa  933    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  100 
 
 		 930 aa  1848    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  40.77 
 
 		 946 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  40.94 
 
 		 944 aa  582  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  40.58 
 
 		 935 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  41.08 
 
 		 507 aa  266  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  35.22 
 
 		 529 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  34.69 
 
 		 533 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  35.37 
 
 		 525 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  34.32 
 
 		 554 aa  193  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  33.02 
 
 		 446 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  33.57 
 
 		 526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  37.18 
 
 		 390 aa  184  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  39.6 
 
 		 499 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  38.59 
 
 		 473 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  38.41 
 
 		 449 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  41.39 
 
 		 464 aa  168  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  38.71 
 
 		 490 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.22 
 
 		 561 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  32.92 
 
 		 433 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.36 
 
 		 464 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  34.81 
 
 		 392 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.26 
 
 		 561 aa  135  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  33.02 
 
 		 432 aa  128  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  28.69 
 
 		 425 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  28.27 
 
 		 429 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  32.02 
 
 		 430 aa  92  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1486 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>