31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0090 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  933    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  38.98 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  39.4 
 
 		 433 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.06 
 
 		 561 aa  216  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  41.69 
 
 		 490 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  37.78 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.03 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  41.81 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  36.86 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 967 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  37.5 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  36.65 
 
 		 526 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  37.4 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  37.36 
 
 		 930 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  40.89 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  35.8 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  31.94 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  35.74 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  27.63 
 
 		 935 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  32.03 
 
 		 944 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 946 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  35.55 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  36.02 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  37.05 
 
 		 533 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  34.54 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  34.94 
 
 		 525 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 564 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4720  hypothetical protein  26.71 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  35.87 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  34.78 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>