29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0312 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1055    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  55.38 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  50.47 
 
 		 529 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  39.24 
 
 		 935 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  32.32 
 
 		 967 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  34.63 
 
 		 930 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  33.41 
 
 		 944 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 946 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  37.22 
 
 		 473 aa  163  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  33.59 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  32.04 
 
 		 533 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  31.47 
 
 		 526 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  30.84 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  36.19 
 
 		 464 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.6 
 
 		 561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  37.98 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  40.09 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  35.69 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  36.19 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  35.69 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  36.7 
 
 		 499 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  36.75 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.6 
 
 		 561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 564 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  35.45 
 
 		 432 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  33.16 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  30.19 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1486 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>