28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0378 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  100 
 
 
935 aa  1860    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  39.75 
 
 
930 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  39.04 
 
 
967 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  36.62 
 
 
944 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  36.71 
 
 
946 aa  479  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  40.49 
 
 
507 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  39.24 
 
 
525 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  34.61 
 
 
529 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  38.21 
 
 
526 aa  193  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  39.74 
 
 
473 aa  187  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  34.32 
 
 
446 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  32.58 
 
 
533 aa  174  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  34.75 
 
 
390 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 
564 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  30.29 
 
 
499 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  36.78 
 
 
392 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  31.74 
 
 
554 aa  146  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  28.21 
 
 
490 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  33.9 
 
 
433 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  36.26 
 
 
464 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  33.75 
 
 
449 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.43 
 
 
561 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  33.96 
 
 
464 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  32.57 
 
 
425 aa  118  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.65 
 
 
561 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  25.98 
 
 
429 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  31.18 
 
 
432 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  29.25 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>