36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3856 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.82 
 
 		 464 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  45.45 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  39.35 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  37.33 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  33.72 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  35.89 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.65 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  32.03 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  36.97 
 
 		 561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  33.52 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  33.97 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  38.71 
 
 		 554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.01 
 
 		 561 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  34.21 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  32.09 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 930 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 946 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  31.16 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  31.9 
 
 		 967 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  32.99 
 
 		 944 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 935 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  35.94 
 
 		 525 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  36.18 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  29.3 
 
 		 533 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  36.69 
 
 		 507 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  29.51 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  32.69 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  33.65 
 
 		 379 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.4 
 
 		 853 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4720  hypothetical protein  28.1 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.56 
 
 		 934 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  23.6 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  32.67 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>