35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3194 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  871    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  79.91 
 
 
430 aa  726    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  48.09 
 
 
425 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  38.06 
 
 
433 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  38.18 
 
 
499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  34.85 
 
 
464 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  32.89 
 
 
449 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.4 
 
 
464 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  40.32 
 
 
490 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.25 
 
 
561 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.86 
 
 
561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  34.29 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  36.04 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  33.13 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  36.79 
 
 
944 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  35.89 
 
 
946 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  31.37 
 
 
473 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  36.45 
 
 
526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  31.61 
 
 
967 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  31.33 
 
 
390 aa  113  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  37.44 
 
 
554 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  28.27 
 
 
930 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  25.98 
 
 
935 aa  106  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  29.81 
 
 
507 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  25 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  29.61 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 
564 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  32.45 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  41.86 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  37.65 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  29.73 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  34.88 
 
 
1486 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  20.73 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  26.92 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>