37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1717 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  934    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  42.74 
 
 		 499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  40.66 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  38.59 
 
 		 432 aa  219  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.22 
 
 		 561 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  39.17 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  38.85 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.78 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  38.02 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  38.94 
 
 		 967 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  40.44 
 
 		 930 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  36.43 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.74 
 
 		 561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  35.24 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  39.69 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  31.97 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  38.31 
 
 		 526 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  34.85 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  33.88 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  33.68 
 
 		 944 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  35.89 
 
 		 946 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  36.26 
 
 		 935 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  37.04 
 
 		 507 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  36.44 
 
 		 525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  38.36 
 
 		 529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 564 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  31.98 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  40.79 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  35.63 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1486 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  34.83 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  32.95 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6375  hypothetical protein  32.61 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>