34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01820 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  764    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  38.83 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  36.34 
 
 		 967 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  36.9 
 
 		 930 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  34.64 
 
 		 935 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  35.76 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  32.16 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  40.39 
 
 		 946 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  39.27 
 
 		 944 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  34.88 
 
 		 425 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  34.64 
 
 		 526 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  35.79 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  34.39 
 
 		 473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  32.34 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.47 
 
 		 561 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  31.16 
 
 		 499 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  36.72 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  36.7 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  34.07 
 
 		 554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  37.98 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  35.97 
 
 		 529 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  31.73 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  33.92 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  31.08 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 564 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  33.66 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.77 
 
 		 561 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  40.58 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  37.68 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  29.67 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  36.11 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1486 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  32.95 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>