35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1989 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  939    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  50 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  42.49 
 
 		 526 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  44.59 
 
 		 499 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  35.33 
 
 		 967 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  39.74 
 
 		 935 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  39.55 
 
 		 930 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  39.16 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  40.14 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.14 
 
 		 464 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  36.19 
 
 		 946 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  35.65 
 
 		 490 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  36.19 
 
 		 944 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  40 
 
 		 507 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  38.19 
 
 		 525 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  37.84 
 
 		 561 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  35.12 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  37.59 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  40.49 
 
 		 392 aa  156  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.24 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.15 
 
 		 425 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  37.89 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  35.49 
 
 		 529 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  34.74 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  32.67 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  31.37 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  28.61 
 
 		 430 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 564 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  43.96 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  41.57 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.76 
 
 		 934 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  28.93 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  27.11 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  32.99 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>