28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2439 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1055    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  50.28 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  44.26 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  34.77 
 
 		 935 aa  233  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  34.9 
 
 		 930 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  34.94 
 
 		 967 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  31.5 
 
 		 946 aa  170  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 944 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  44.81 
 
 		 446 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  30.28 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  35.49 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  32.74 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  28.71 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 564 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  37.78 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  36.33 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  39.17 
 
 		 464 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  33.79 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  36.86 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  38.6 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  36.32 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  33.69 
 
 		 425 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.38 
 
 		 561 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.79 
 
 		 561 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  38.82 
 
 		 432 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  24.93 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  26.78 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>