28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1494 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 564 aa  1144    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  33.88 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  30.8 
 
 		 967 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  36.12 
 
 		 935 aa  160  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  31.31 
 
 		 930 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 946 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 944 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  32.24 
 
 		 529 aa  134  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  34.82 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  30.61 
 
 		 433 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  30.82 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  30.83 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  34.38 
 
 		 507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  31.72 
 
 		 390 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  28.43 
 
 		 525 aa  107  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  29.47 
 
 		 473 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  27.93 
 
 		 392 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  30.77 
 
 		 526 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  28.43 
 
 		 425 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  31.17 
 
 		 490 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  32.74 
 
 		 449 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  29.02 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  29.43 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  27.89 
 
 		 464 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  26.07 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  24.6 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  23.77 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>