33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3602 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3602  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  898    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000620867  hitchhiker  0.000696786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4229  hypothetical protein  46.2 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  37.53 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0175  hypothetical protein  38.33 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0831  hypothetical protein  40.51 
 
 		 499 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1717  hypothetical protein  38.35 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4889  hypothetical protein  36.93 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2577  putative lipoprotein  39.59 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  36.67 
 
 		 561 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0090  hypothetical protein  38.4 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3256  hypothetical protein  41.74 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.919828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1989  hypothetical protein  38.44 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03437  putative lipoprotein  38.22 
 
 		 930 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3994  putative lipoprotein  36.34 
 
 		 967 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  40.08 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.14 
 
 		 561 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3194  hypothetical protein  32.81 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.638236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0983  hypothetical protein  32.61 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0546  hypothetical protein  37.15 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3581  putative lipoprotein  34.7 
 
 		 944 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0636  putative lipoprotein  36.65 
 
 		 946 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0378  putative lipoprotein  33.78 
 
 		 935 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.483556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2574  hypothetical protein  38.2 
 
 		 507 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2439  hypothetical protein  33.68 
 
 		 529 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.948667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0312  hypothetical protein  36.91 
 
 		 525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1055  hypothetical protein  31.43 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01820  hypothetical protein  33.92 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1494  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 		 564 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  31.18 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  32.48 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  30.17 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  32.29 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>