17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2772 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  57.87 
 
 		 833 aa  955    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  58.95 
 
 		 832 aa  983    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 853 aa  1736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 445 aa  144  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  28.9 
 
 		 415 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  28.13 
 
 		 379 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  37.04 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 454 aa  118  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  27.22 
 
 		 386 aa  118  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 326 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  32.16 
 
 		 669 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  25.76 
 
 		 473 aa  91.3  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  23.56 
 
 		 428 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.02 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.99 
 
 		 934 aa  48.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3856  hypothetical protein  27.19 
 
 		 432 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.879763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.58 
 
 		 1332 aa  44.3  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>