17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0591 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0575  hypothetical protein  57.32 
 
 
669 aa  751    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0591  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1348    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.56 
 
 
326 aa  137  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.57 
 
 
832 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  36.11 
 
 
833 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.04 
 
 
853 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2257  hypothetical protein  27 
 
 
415 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000220648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3071  hypothetical protein  28.96 
 
 
379 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1203  hypothetical protein  28.78 
 
 
386 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0500702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  34.29 
 
 
445 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1869  putative lipoprotein  27.54 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.822905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2317  lipoprotein, putative  26.38 
 
 
473 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2496  putative lipoprotein  38.33 
 
 
428 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0503424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0590  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0548  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0576  hypothetical protein  29.45 
 
 
264 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2771  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0188969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>