44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2082 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2082  hypothetical protein  100 
 
 		 1703 aa  2895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112234 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  41.21 
 
 		 2449 aa  161  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  35.89 
 
 		 521 aa  145  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  26.64 
 
 		 1186 aa  82.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  53.03 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  27.34 
 
 		 1068 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  30.77 
 
 		 1859 aa  79.7  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2059  hypothetical protein  46.6 
 
 		 231 aa  79.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0548738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  51.14 
 
 		 848 aa  79.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  76.19 
 
 		 1781 aa  78.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  27.2 
 
 		 962 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  26.49 
 
 		 1012 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6141  secreted trypsin-like serine protease  34.57 
 
 		 94 aa  68.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  29.12 
 
 		 522 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  28.7 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  40.43 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.7 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  33.92 
 
 		 1860 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  52.17 
 
 		 228 aa  61.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  28.99 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  28.99 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  23.95 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  38.82 
 
 		 1745 aa  58.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6592  protein of unknown function DUF1175  31.71 
 
 		 327 aa  58.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191947  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5314  Putative membrane protein involved in toxin uptake  30.77 
 
 		 944 aa  57.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  53.33 
 
 		 1594 aa  57  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  19.89 
 
 		 1297 aa  56.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34250  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  44.58 
 
 		 850 aa  56.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.137913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  27.75 
 
 		 490 aa  55.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  41.94 
 
 		 459 aa  55.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  71.43 
 
 		 1407 aa  52.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  50.86 
 
 		 347 aa  52.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  50.86 
 
 		 347 aa  52.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  52.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.58 
 
 		 462 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4461  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1057 aa  51.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.44 
 
 		 2105 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  18.55 
 
 		 737 aa  50.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  25.7 
 
 		 827 aa  50.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  22.58 
 
 		 479 aa  50.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  46.46 
 
 		 300 aa  49.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  34.69 
 
 		 667 aa  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  37.7 
 
 		 653 aa  46.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  30.64 
 
 		 1034 aa  45.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>