16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1596 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1097    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1556  hypothetical protein  74.22 
 
 		 544 aa  749    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2910  fibronectin, type III domain-containing protein  45.35 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3110  fibronectin type III domain-containing protein  40.7 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5505  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 712 aa  77  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.66 
 
 		 2449 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1068 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  30.41 
 
 		 675 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5535  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 731 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193423  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 1262 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 843 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 		 1185 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 837 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 		 1056 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1088 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 1050 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>