35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4115 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  800    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  41.59 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  39.52 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  34.76 
 
 		 348 aa  86.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  34.19 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  32.05 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  29.89 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  30.7 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  41.6 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  30.04 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  33.02 
 
 		 809 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  30.87 
 
 		 497 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  35.24 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  28.4 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  35.4 
 
 		 757 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  32.73 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  31.5 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  34.43 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  30.55 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  30.65 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  33.61 
 
 		 311 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  31.82 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  27.98 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  35.29 
 
 		 1197 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  32.53 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  31.05 
 
 		 619 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  30.58 
 
 		 684 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2449 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 217 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  27.27 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.7 
 
 		 1888 aa  47.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  29.24 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  32.38 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  24.48 
 
 		 2196 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  32.08 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>