39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0355 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  100 
 
 		 431 aa  850    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  70.83 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  59.91 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  62.07 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  63.48 
 
 		 452 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  40.56 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  38.94 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  38.19 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  35.89 
 
 		 461 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  39.78 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  34.25 
 
 		 817 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  41.29 
 
 		 680 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  42.15 
 
 		 753 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  33.58 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  34.46 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  28.69 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.74 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  28.04 
 
 		 809 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  30.47 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.19 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  34.2 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  27 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  29.27 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  28.62 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30.27 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  29.95 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  28.99 
 
 		 498 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  30.46 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  24.61 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  27.13 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  29.16 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  32.12 
 
 		 757 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  35.48 
 
 		 646 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  31.97 
 
 		 217 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  31.54 
 
 		 305 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3123  hypothetical protein  34.27 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2641  hypothetical protein  36.05 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.849671  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  28.46 
 
 		 247 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>