29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1279 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  100 
 
 		 363 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  37.11 
 
 		 441 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  39.15 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  37.7 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  37.57 
 
 		 427 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  34.59 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  34.14 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  41.09 
 
 		 680 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  40.1 
 
 		 461 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  32.14 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  31.79 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  39.32 
 
 		 619 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  38 
 
 		 817 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  38.07 
 
 		 753 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  32.55 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  32.98 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.4 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  32.84 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.16 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  31.61 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  27.64 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  32.03 
 
 		 809 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  30.67 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  28.63 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  33.62 
 
 		 757 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  34.73 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  35 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.65 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25 
 
 		 2196 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>