32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1733 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  100 
 
 
817 aa  1585    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  55.35 
 
 
680 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  44.44 
 
 
619 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  45.75 
 
 
753 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  49.16 
 
 
461 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  34.42 
 
 
441 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  38.55 
 
 
431 aa  134  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  39.75 
 
 
427 aa  126  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  32.2 
 
 
452 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  37.16 
 
 
428 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  32.27 
 
 
418 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  38 
 
 
363 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  36.05 
 
 
427 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  34.76 
 
 
408 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  28.57 
 
 
498 aa  87.8  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  28.17 
 
 
497 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.72 
 
 
537 aa  80.5  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  33 
 
 
809 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  31.97 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  28.27 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  28.37 
 
 
435 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  32.74 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  34.58 
 
 
446 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  30.77 
 
 
395 aa  59.3  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  33.96 
 
 
351 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  27.5 
 
 
684 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3203  hypothetical protein  25.11 
 
 
1361 aa  54.7  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0413403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  26.32 
 
 
325 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  29.46 
 
 
404 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  28.91 
 
 
385 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.71 
 
 
510 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  25.63 
 
 
388 aa  48.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>