28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3614 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1560    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  72.14 
 
 		 757 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  36.9 
 
 		 497 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  35.07 
 
 		 684 aa  108  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  34.57 
 
 		 498 aa  106  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  33 
 
 		 817 aa  81.3  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  28.41 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  27.01 
 
 		 435 aa  72  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  30.28 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  30.28 
 
 		 427 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  33.95 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  32.81 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.27 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  27.63 
 
 		 431 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  34.25 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  32.41 
 
 		 351 aa  63.9  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.71 
 
 		 395 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  31.19 
 
 		 461 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  28.37 
 
 		 385 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  30.56 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  30.99 
 
 		 680 aa  55.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  29.03 
 
 		 427 aa  55.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  31.7 
 
 		 363 aa  51.2  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  30.98 
 
 		 753 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  33.33 
 
 		 1197 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  27.73 
 
 		 199 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  36.57 
 
 		 217 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  27.54 
 
 		 304 aa  44.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>