42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3894 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  840    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  75.6 
 
 		 452 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  75.51 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  67.65 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  61.59 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  41.33 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  42.21 
 
 		 418 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  41.31 
 
 		 427 aa  220  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  39.66 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  40.26 
 
 		 619 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  36.08 
 
 		 363 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  45.54 
 
 		 680 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  37.8 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  34.42 
 
 		 817 aa  147  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  41.84 
 
 		 753 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  27.65 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.7 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  30.21 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  29.29 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  25.69 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  29.05 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  27.82 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  30.68 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  25 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  30.72 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  34.25 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30.46 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  32.83 
 
 		 684 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  27.06 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  31.6 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  32.64 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3203  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1361 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0413403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  34.85 
 
 		 757 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  30.87 
 
 		 1197 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  29.75 
 
 		 467 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3123  hypothetical protein  37.82 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  28.49 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1283  agglutinin receptor  24.91 
 
 		 1631 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  35.76 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  23.93 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  38.96 
 
 		 235 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  31.23 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>