25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0192 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  761    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  48.06 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  41.15 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  37.55 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  34.3 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  30.46 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  28.5 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  32.56 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  34.12 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  30.94 
 
 		 619 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  37.31 
 
 		 684 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  33.91 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  26.63 
 
 		 817 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  30.05 
 
 		 680 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  30.05 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  35.19 
 
 		 217 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  29.7 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  29.94 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.17 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  33.94 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  29.95 
 
 		 235 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  30.74 
 
 		 753 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  30.92 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02600  cytoskeletal regulatory protein binding protein, putative  29.33 
 
 		 1172 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.112151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>