36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1610 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  67.59 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  68.35 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  41.73 
 
 		 441 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  43.97 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  43.43 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  44.92 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  43.67 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  40.56 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  32.03 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  39.17 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  41.32 
 
 		 619 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  34.76 
 
 		 817 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  38.16 
 
 		 363 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  36.7 
 
 		 753 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  29.11 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.4 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  27.86 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  30.56 
 
 		 809 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  36.92 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  29.59 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  28.16 
 
 		 498 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  23.65 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.9 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  22.77 
 
 		 1359 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  29.74 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  32.17 
 
 		 351 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  27.68 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  36.52 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1236  DivIVA family protein  30.05 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  30.43 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  32.4 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  27.02 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  31.56 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  32.08 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  27.78 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>