50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9130 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  54.16 
 
 
351 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  33.57 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  41.98 
 
 
388 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  27.31 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  32.81 
 
 
427 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  32.64 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.86 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  31.95 
 
 
441 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  29.55 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  28.37 
 
 
809 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  29.18 
 
 
510 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  33.99 
 
 
684 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  30.61 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  32.24 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  32.77 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  32.39 
 
 
619 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  30.36 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  29.74 
 
 
408 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  42.35 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  33.8 
 
 
245 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  33.8 
 
 
245 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  33.8 
 
 
245 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  31.05 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  30.58 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  29.01 
 
 
817 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0730  hypothetical protein  32.23 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000195615  normal  0.756936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  37.65 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  39.67 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  31.46 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  34.56 
 
 
235 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  24.72 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  25.09 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  31.4 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  30.58 
 
 
274 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  36.78 
 
 
245 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  32.61 
 
 
273 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  29.05 
 
 
277 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  32.54 
 
 
680 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  30.19 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  29.72 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  33.7 
 
 
757 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  30.08 
 
 
497 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1236  DivIVA family protein  28.99 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3691  hypothetical protein  33.83 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  26.81 
 
 
199 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  39.08 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  24.62 
 
 
498 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  36.67 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>