29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2425 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  863    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  51.73 
 
 
619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  64.22 
 
 
753 aa  246  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  53.21 
 
 
680 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  39.62 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  37.61 
 
 
817 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  41.36 
 
 
452 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  39.71 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  39.6 
 
 
427 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  35.77 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  31.87 
 
 
427 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  31.87 
 
 
418 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  33.01 
 
 
408 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  40.18 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.42 
 
 
537 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  26.37 
 
 
474 aa  84  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  28.99 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  29.08 
 
 
317 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  32.51 
 
 
446 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  31.76 
 
 
325 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  30.24 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  28.17 
 
 
809 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  28.27 
 
 
497 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  30.04 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  33.68 
 
 
757 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  30.87 
 
 
351 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  29.72 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  25.28 
 
 
394 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  29.93 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>