30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3996 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  67.86 
 
 		 809 aa  1040    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1474    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  29.93 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  30.55 
 
 		 817 aa  111  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  34.1 
 
 		 498 aa  105  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 684 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  31.31 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  31.31 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  32.25 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  31.99 
 
 		 441 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  29.74 
 
 		 395 aa  70.5  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.11 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  33.9 
 
 		 420 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  33.19 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  38.73 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  34.65 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  33.2 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  32.48 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  25.97 
 
 		 619 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  32.71 
 
 		 461 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  31.82 
 
 		 351 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  35.87 
 
 		 427 aa  51.6  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  30.36 
 
 		 385 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  34.25 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.31 
 
 		 537 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  31.54 
 
 		 217 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.77 
 
 		 1112 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.83 
 
 		 1328 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  29.53 
 
 		 317 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  29.79 
 
 		 304 aa  44.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>