23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2150 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  35.26 
 
 
351 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  35 
 
 
420 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  30.81 
 
 
260 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  32.23 
 
 
431 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  33.16 
 
 
809 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  31.67 
 
 
452 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
166 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  28.17 
 
 
266 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  26.97 
 
 
394 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  31.34 
 
 
757 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.1 
 
 
385 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  27.81 
 
 
272 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  28.48 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  27.81 
 
 
272 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  31.29 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  27.81 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  29.33 
 
 
276 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.76 
 
 
435 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  31.06 
 
 
325 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  30.99 
 
 
418 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  30.23 
 
 
441 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  41.67 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>