31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3995 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  97.22 
 
 
427 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  798    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  69.07 
 
 
408 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  41.94 
 
 
441 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  41.54 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  41.6 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  43.05 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  41.1 
 
 
427 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  38.4 
 
 
431 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  31.87 
 
 
461 aa  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  33.24 
 
 
817 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  40.55 
 
 
680 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  39.42 
 
 
619 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  36.99 
 
 
753 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  32.88 
 
 
363 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  30.73 
 
 
809 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  29.32 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.74 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  37.59 
 
 
757 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  29.03 
 
 
497 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  30.71 
 
 
498 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.17 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  33.2 
 
 
351 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1236  DivIVA family protein  32.48 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  28.51 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  24.7 
 
 
435 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30.6 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  27.27 
 
 
273 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  23.76 
 
 
3060 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>