31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3613 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  816    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  97.22 
 
 		 418 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  68.3 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  40.19 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  41.19 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  40.49 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  41.36 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  41.42 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  39.18 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  31.87 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  31.38 
 
 		 817 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  39.82 
 
 		 680 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  39.16 
 
 		 619 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  37.9 
 
 		 753 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  33.78 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  30.73 
 
 		 809 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  28.16 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.62 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  29.41 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  36.88 
 
 		 757 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  29.75 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  31.18 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.42 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  33.81 
 
 		 684 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  33.2 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1236  DivIVA family protein  33.12 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  30.36 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  31.42 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30.6 
 
 		 325 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  28.51 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  28.1 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>