32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1089 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  100 
 
 
753 aa  1394    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  52.17 
 
 
619 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  51.04 
 
 
680 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  43.07 
 
 
817 aa  402  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  50 
 
 
461 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  41.18 
 
 
441 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  42.41 
 
 
452 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  41.72 
 
 
428 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  40.94 
 
 
431 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  41.33 
 
 
427 aa  126  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  36.99 
 
 
418 aa  104  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  36.99 
 
 
427 aa  104  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  38.07 
 
 
363 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  37.2 
 
 
408 aa  92  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.52 
 
 
537 aa  81.6  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  28.42 
 
 
474 aa  77  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  28.75 
 
 
497 aa  61.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  30.77 
 
 
1197 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  33.2 
 
 
446 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  28.55 
 
 
684 aa  54.3  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  32.04 
 
 
317 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  31.98 
 
 
404 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  33.22 
 
 
498 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  29.62 
 
 
809 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0730  hypothetical protein  22.01 
 
 
242 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000195615  normal  0.756936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30.36 
 
 
325 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  31.07 
 
 
420 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  25.14 
 
 
394 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  27.81 
 
 
435 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  33.61 
 
 
306 aa  44.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  44.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  28.63 
 
 
273 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>