29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1948 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  65.85 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  40.87 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  43.46 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  38.1 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.34 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  31.06 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  32.26 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  32.75 
 
 		 467 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  39.64 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  35.71 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  38.78 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  33.63 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  37.71 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  33.77 
 
 		 408 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  32.77 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  28.24 
 
 		 817 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  31.68 
 
 		 619 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  31.2 
 
 		 441 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  41.05 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  31.42 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  32.81 
 
 		 461 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  33.98 
 
 		 753 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  27.97 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  31.82 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  32.42 
 
 		 427 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35260  hypothetical protein  33.63 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  29.27 
 
 		 757 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  34.67 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>