13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  591  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  32.74 
 
 		 435 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  33.45 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  37.73 
 
 		 395 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  37.88 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  29.75 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  33.5 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  31.95 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.56 
 
 		 510 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  33.04 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  30.61 
 
 		 680 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  35.48 
 
 		 497 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  25.95 
 
 		 985 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>