15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  36.36 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  34.8 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  27.6 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  32.87 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  35.27 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  30.21 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  31.06 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  36.07 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  36.41 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  30.33 
 
 		 497 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  27.54 
 
 		 809 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  29.79 
 
 		 757 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  58.54 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  31.45 
 
 		 2400 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>