34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  63.3 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  36.06 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  34.8 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  40.69 
 
 		 420 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  43.72 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  29.7 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  29.55 
 
 		 467 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  38.6 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  36.46 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  29.33 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  28.98 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  30.73 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  28.71 
 
 		 809 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  30.77 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35260  hypothetical protein  31.65 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  28.42 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  33.86 
 
 		 757 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  30.99 
 
 		 619 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  31.58 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  37.39 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.2 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  31.5 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  28.08 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  28.68 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  28.07 
 
 		 1197 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  30.12 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  27.27 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  28.17 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  30 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  27.3 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.32 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  30.53 
 
 		 684 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  31.78 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>