48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2396 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  100 
 
 		 427 aa  823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  68.1 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  70.83 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  66.74 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  70.93 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  43.11 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  41.21 
 
 		 427 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  40.95 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  38.77 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  37.24 
 
 		 619 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  33.97 
 
 		 817 aa  143  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  36.87 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  40.42 
 
 		 753 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  35.95 
 
 		 363 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  40.1 
 
 		 680 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  29.84 
 
 		 317 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.94 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.2 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  34 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  27.95 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.47 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  31.25 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  29.52 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  34.34 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  27.2 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  32.26 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  28.68 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  31.82 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  28.68 
 
 		 394 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  30.93 
 
 		 305 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  34.75 
 
 		 757 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  29.09 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  29.62 
 
 		 684 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  28.64 
 
 		 1197 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3123  hypothetical protein  37.14 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  31.85 
 
 		 292 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3203  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1361 aa  46.6  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0413403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  32.34 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  24.46 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  32.03 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  30.95 
 
 		 247 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  32.35 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  27.35 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  28.79 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>