72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3055 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  46.38 
 
 
285 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  41.3 
 
 
291 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  44.21 
 
 
289 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  42.68 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  43.11 
 
 
280 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  46.15 
 
 
347 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  40.52 
 
 
302 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  37.15 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  39.06 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  37.16 
 
 
276 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  37.55 
 
 
270 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1578  DivIVA family protein  37.65 
 
 
232 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  34.48 
 
 
273 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  39.37 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  34.34 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  36.96 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1579  DivIVA family protein  36.6 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  37.55 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  33.85 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  33.85 
 
 
272 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  33.85 
 
 
272 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  36.78 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  33.2 
 
 
281 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10880  DivIVA protein  33.73 
 
 
237 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00392112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13520  DivIVA protein  37.67 
 
 
195 aa  95.9  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457653  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1602  DivIVA domain protein  33.47 
 
 
224 aa  96.3  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0814856  normal  0.685906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22730  DivIVA protein  33.76 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0597126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2403  DivIVA family protein  31.12 
 
 
238 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666142  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1291  DivIVA family protein  31.92 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1081  DivIVA family protein  31.92 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.244435  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  35.77 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  56.94 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3191  DivIVA family protein  63.16 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1410  DivIVA family protein  28.18 
 
 
222 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16490  DivIVA protein  48.08 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.537974  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0597  DivIVA family protein  22.63 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000335111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  52.38 
 
 
350 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  32.32 
 
 
442 aa  50.8  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1348  DivIVA family protein  26.71 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254169  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  31.69 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2545  DivIVA family protein  26.02 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  25.43 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  56.25 
 
 
452 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4396  DivIVA domain protein  53.66 
 
 
233 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  45.45 
 
 
141 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3747  cell-division initiation protein DivIVA  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3910  cell-division initiation protein DivIVA  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000004632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1244  cell-division initiation protein DivIVA  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00035282  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3997  cell-division initiation protein DivIVA  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3638  cell-division initiation protein (DivIVA)  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0761533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3655  cell-division initiation protein (DivIVA)  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4035  cell-division initiation protein DivIVA  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0113454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3723  DivIVA family protein  25.51 
 
 
168 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0113973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1819  cell division protein DivIVA, putative  26.88 
 
 
208 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00249863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2228  DivIVA domain protein  26.36 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  30.57 
 
 
290 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  26.47 
 
 
168 aa  45.4  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09410  DivIVA protein  29 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0738055  normal  0.126085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1908  DivIVA domain protein  45.28 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2105  putative cell division protein DivIVA  26.88 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3941  cell-division initiation protein DivIVA  25 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1038  DivIVA family protein  28.21 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142308  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0923  cell division protein GpsB  35.8 
 
 
120 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.932524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  27.49 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3948  cell-division initiation protein DivIVA  25 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402418  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0782  cell division initiation protein  26.21 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.343378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  30.95 
 
 
427 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  34.18 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  27.27 
 
 
161 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0862  hypothetical protein  26.63 
 
 
184 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00599598  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1087  DivIVA family protein  23.28 
 
 
206 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386822  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>