52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0915 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  870    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  78.32 
 
 		 428 aa  624  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  75.38 
 
 		 441 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  64.46 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  58.09 
 
 		 431 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  44.02 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  41.56 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  40.81 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  39.66 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  44.78 
 
 		 619 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  39.05 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  37.43 
 
 		 363 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  46.04 
 
 		 680 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  43.36 
 
 		 753 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  32.37 
 
 		 817 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  31.23 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.38 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  27.11 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  33.46 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  33.99 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.47 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  28.49 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  32.66 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  33.17 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  35.88 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  32.26 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  27.55 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  30.92 
 
 		 510 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  32.21 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  29.69 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3203  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1361 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0413403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  37.86 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  29.57 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  32.32 
 
 		 684 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  27.55 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  30.26 
 
 		 1197 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3123  hypothetical protein  36.81 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  43.08 
 
 		 263 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  41.07 
 
 		 465 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  31.67 
 
 		 217 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  36.96 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  44.16 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  44.16 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1197  cell division initiation protein  26.62 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  32.41 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  33.64 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  41.46 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  39.71 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  39.71 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  39.62 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  39.71 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2641  hypothetical protein  34.88 
 
 		 298 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.849671  normal  0.281476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>