34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1273    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  55.35 
 
 		 817 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  50.64 
 
 		 753 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  48.96 
 
 		 619 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  56.71 
 
 		 461 aa  230  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  45.59 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  46.08 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  41.29 
 
 		 431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  39.52 
 
 		 428 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  41.09 
 
 		 363 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  40.64 
 
 		 418 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  39.91 
 
 		 427 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  37.09 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  39.73 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  32.57 
 
 		 325 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  31.18 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  25.64 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  33.04 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  28.51 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  29.96 
 
 		 498 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  29.01 
 
 		 497 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  32.26 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  26.94 
 
 		 757 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  24.54 
 
 		 474 aa  54.3  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  31.93 
 
 		 446 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  27.97 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3691  hypothetical protein  32.47 
 
 		 238 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  27.96 
 
 		 435 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  31.05 
 
 		 351 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  26.77 
 
 		 388 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  35.51 
 
 		 235 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  28.65 
 
 		 420 aa  48.5  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  32.54 
 
 		 385 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2006  hypothetical protein  33.7 
 
 		 228 aa  44.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>