27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  100 
 
 		 317 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  28.42 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  28.15 
 
 		 431 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  29.03 
 
 		 427 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  29.63 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  32.31 
 
 		 817 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.54 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  29.73 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  33.13 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  32.18 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  29.82 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.98 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  26.89 
 
 		 427 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  29.77 
 
 		 461 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3691  hypothetical protein  36.69 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  35.05 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  30.14 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  38.69 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  30.5 
 
 		 753 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  26.29 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  28.52 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  32.06 
 
 		 619 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  27.05 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  27.24 
 
 		 385 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  27.65 
 
 		 537 aa  46.2  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  29.17 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  29.72 
 
 		 1197 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>