19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5876 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5876  vesicular transport-associated repeat protein  100 
 
 		 404 aa  748    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547798  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  44.38 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  43.05 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  41.42 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  35.63 
 
 		 441 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  40.21 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  36.73 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  36.83 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  34.58 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  28.75 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  36.27 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  34.12 
 
 		 680 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  32.66 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  30.42 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  27.95 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  29.05 
 
 		 817 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  28.89 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  26.3 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  30.23 
 
 		 753 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>