20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0216 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  915    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  59.43 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  28.9 
 
 		 619 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  26.37 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  24.67 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  28.27 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  26.26 
 
 		 753 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  27.14 
 
 		 452 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  29.52 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  25.6 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  27.64 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  24.61 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  24.54 
 
 		 680 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  24.24 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  24.72 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  28.67 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  28.67 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  28.67 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>