80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12942 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  84.08 
 
 
245 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  83.27 
 
 
245 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  83.27 
 
 
245 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  83.27 
 
 
245 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  83.27 
 
 
245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  69.42 
 
 
277 aa  341  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  65.84 
 
 
263 aa  328  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  59.57 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  58.7 
 
 
238 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  54.89 
 
 
229 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  35.32 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  42.86 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  45.28 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  40.57 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  31.75 
 
 
339 aa  72  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  48.39 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  29.37 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  29.92 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  32.89 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  42.7 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  23.81 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  30.25 
 
 
175 aa  62.4  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  32.33 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  32.52 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  41.38 
 
 
385 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  33.64 
 
 
170 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  35.04 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  35.04 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  29.29 
 
 
177 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  21.67 
 
 
152 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  34.19 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  34.19 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  32.18 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  33.33 
 
 
684 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  30.47 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  35.79 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  32.48 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  24.58 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  35.09 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  34.48 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  43.48 
 
 
351 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  23.81 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  36.67 
 
 
168 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  29.52 
 
 
148 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  32.93 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  22.41 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  22.41 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  25.83 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  22.95 
 
 
145 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  42.37 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  38.38 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  30.19 
 
 
405 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  43.75 
 
 
427 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  30.52 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  31.94 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  26.47 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  24.43 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  29.05 
 
 
1197 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  23.96 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  25.66 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  37.04 
 
 
619 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  22.78 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  33 
 
 
510 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  26.27 
 
 
179 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  28 
 
 
474 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  37.5 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  43.86 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  24.32 
 
 
139 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  43.1 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  25.75 
 
 
345 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  39.39 
 
 
452 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3055  DivIVA family protein  36.51 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  40.48 
 
 
166 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  27.62 
 
 
155 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  26.88 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>