77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1993 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  90.2 
 
 
245 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  91.43 
 
 
245 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  83.27 
 
 
245 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  69.01 
 
 
277 aa  338  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  64.2 
 
 
263 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  57.45 
 
 
250 aa  271  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  55.78 
 
 
229 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  58.3 
 
 
238 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  33.62 
 
 
229 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  41.51 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  32.28 
 
 
339 aa  72  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  45.65 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  45.65 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  23.35 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  30.71 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  45.16 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  42.7 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  32.37 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  36.64 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  32.56 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  26.98 
 
 
162 aa  62.4  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  31.45 
 
 
176 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  38.02 
 
 
272 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  37.19 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  37.19 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  37.37 
 
 
351 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  35.34 
 
 
177 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  32.59 
 
 
170 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  25.95 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  34.71 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  34.71 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  36 
 
 
260 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  33.73 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  33.33 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  34.44 
 
 
684 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  21.26 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.57 
 
 
385 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  27.01 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  22.83 
 
 
153 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  22.39 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  23.71 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  29.33 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  27.62 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  23.71 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  32.56 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  32.73 
 
 
405 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  36.25 
 
 
168 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  38.33 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  34.12 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  40.82 
 
 
427 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  29.52 
 
 
155 aa  45.4  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  23.4 
 
 
145 aa  45.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  39.44 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  30.59 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  27.97 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  36.21 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  44.68 
 
 
394 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  28.67 
 
 
474 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  27.08 
 
 
139 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30.61 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  30.56 
 
 
157 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  31.28 
 
 
809 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  20.25 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  36.46 
 
 
146 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  30.34 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  34.85 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  24.35 
 
 
170 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  28.22 
 
 
510 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  31.33 
 
 
285 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.26 
 
 
170 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  23.39 
 
 
152 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>