15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5484 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  48.96 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  34.21 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  33.59 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  28.04 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  30.72 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  29.02 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.9 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  28.76 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  30.12 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  25.7 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  44.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  44.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  44.68 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>