34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0584 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.85 
 
 
385 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  37.2 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0192  hypothetical protein  35.8 
 
 
388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5484  hypothetical protein  34.21 
 
 
394 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  34.81 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  32.57 
 
 
680 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  35.06 
 
 
452 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  30.64 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  30.95 
 
 
619 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  31.61 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  33.16 
 
 
427 aa  59.7  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.96 
 
 
2449 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  27.98 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  29.95 
 
 
431 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  31.82 
 
 
428 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  30.94 
 
 
461 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  31.1 
 
 
395 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  42.53 
 
 
510 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  26.32 
 
 
817 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  41.94 
 
 
2397 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  33.04 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  31.84 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  30.6 
 
 
427 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  40.45 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  32.63 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  30.6 
 
 
418 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  32.63 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  32.32 
 
 
280 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  31.17 
 
 
684 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  29.67 
 
 
467 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  32.22 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2057  cell division initiation protein  23.51 
 
 
311 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.46149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2150  hypothetical protein  31.45 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0674355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>