42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1609 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  100 
 
 
684 aa  1290    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  35.07 
 
 
809 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  42.18 
 
 
757 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  29.44 
 
 
1197 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  33.71 
 
 
497 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  33.18 
 
 
498 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  29.11 
 
 
817 aa  68.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  32.2 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  28.84 
 
 
441 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  30.06 
 
 
395 aa  60.1  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  29.36 
 
 
408 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  37.06 
 
 
351 aa  58.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  32.78 
 
 
435 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  33.33 
 
 
385 aa  53.9  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  25.31 
 
 
245 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  27.94 
 
 
680 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  28 
 
 
277 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  34.14 
 
 
427 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  28.29 
 
 
263 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  39.78 
 
 
271 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  39.78 
 
 
272 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  39.78 
 
 
272 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  39.78 
 
 
272 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  30.1 
 
 
427 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  27.04 
 
 
619 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1080  hypothetical protein  25.73 
 
 
537 aa  49.7  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  36.56 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  39.77 
 
 
260 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  25.83 
 
 
467 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  27.5 
 
 
753 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  30.92 
 
 
452 aa  48.5  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  27.48 
 
 
317 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  38.71 
 
 
274 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0216  hypothetical protein  25.75 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2928  pseudouridine synthase  19.29 
 
 
477 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  31.39 
 
 
325 aa  45.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  28.98 
 
 
428 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  31.51 
 
 
218 aa  43.9  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>