65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1880 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  100 
 
 
250 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  59.57 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  59.57 
 
 
245 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  57.45 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  57.45 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  57.45 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  56 
 
 
277 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  56.56 
 
 
263 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  57.74 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  59.15 
 
 
245 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  57.45 
 
 
229 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  37.87 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  36.53 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  36.91 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  34.97 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  34.29 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  25.45 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  29.82 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  34.65 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  28.73 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  35.61 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  33.57 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  29.92 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  33.8 
 
 
175 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  40.62 
 
 
162 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  34.96 
 
 
510 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  37.35 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  31.4 
 
 
148 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  27.03 
 
 
152 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  45.56 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  34.33 
 
 
405 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  31.58 
 
 
145 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  28.21 
 
 
177 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  24.18 
 
 
231 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  24.18 
 
 
231 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  36.61 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  42.35 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.75 
 
 
146 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  46.99 
 
 
351 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  35.71 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  26.97 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  23.83 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  25.2 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  33.04 
 
 
177 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  34.38 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  24.81 
 
 
145 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.9 
 
 
170 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  25.81 
 
 
152 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  45.65 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  41.46 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  30.23 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  35.48 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  23.27 
 
 
145 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  21.58 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  33.04 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  33.65 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  42.37 
 
 
406 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  33.04 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  33.04 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  36.67 
 
 
292 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1794  hypothetical protein  41.67 
 
 
446 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3016  HflK protein  26.32 
 
 
377 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.579125  normal  0.214835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>